得知被骗的陈奇瑜怒不可遏，可是也没有办法，这时候再追击已经来不及了，正巧又赶上朝廷，御史傅永淳复劾奇瑜解陇州围报首功不实，接着给事中顾国宝弹劾奇瑜误国，崇祯皇帝就把陈奇瑜下狱拿问了。
陈奇瑜这边出事了，反倒是洪承畴驱赶部分起义军北上的事情成功了，被追的无路可逃的起义军，顺着子午道、傥骆道、褒斜道、陈仓道等栈道返回陕西。
这些地方唐军自然不可能不派兵驻守，只不过现在正值曹文昭攻击固原、李本原率兵在草原上的时候，陕西境内的唐军兵力不足，每个地方驻守的是有数百人，面对蜂拥而来的义军，驻军一面拼死抵抗一面向着西安和宝鸡求援。
接到求援的王树亭和曹文昭，紧急抽调援兵支援，这使得西安所剩下的守兵直接降到了四位数，曹文昭也不得不暂停对固原镇和宁夏镇的攻略，转而先处理来自后方的威胁。
曹文昭派遣自己的侄子曹变蛟和部将萧动，统领五千兵马增援褒斜道和陈仓道，随着援军的到达，各个关口得以稳定，面对前有堵截后有追兵，早就已经人困马乏的义军选择了投降，洪承畴的杀降之名早就传遍了义军，自然不可能返回投降洪承畴，数万的义军和百姓，对着唐军放下了武器。
曹变蛟和萧动一商量，趁着手中有五千兵马，再加上投降过来的义军，两人手上能动用的兵力也达到了一两万人，干脆不如顺着陈仓道南下直接攻击汉中，一面整编部队，一面向曹文昭报告自己的方案。
曹文昭接到消息之后，也觉得可行，再次从军中抽调了五千兵马和数十门火炮补充给曹变蛟，让他伺机攻击汉中府。
再说起义军这边，自从逃离之后，高迎祥、李自成等率部进入河南，连克陈州，灵宝、汜水、荥阳等地，起义军的人数又重新增长到了十余万人。
占据荥阳之后，高迎祥在荥阳召集各路义军十三家七十二营首领大会荥阳，共商应敌之策。
在会议之上，李自成提出：“一夫犹奋，况十万众乎！官兵无能为也，宜分兵定所向，利钝听之天”的建议，众家首领都认为李自成的建议最为可行，于是兵分路四出击。
高迎祥、李自成、张献忠等先是率部东进，破霍丘、攻寿州、入颍州，杀知州尹梦龙、州判赵士宽、尚书张鹤鸣。乘胜快速突袭了凤阳，焚烧皇陵，杀留守朱相国、指挥袁瑞征、吕承荫、知府颜答暄、推官万文英等一众大明官员。
崇祯听闻祖坟被人给扒了，几欲惊死，素服避殿，哭告祖庙。还在菜市口斩了凤阳巡抚杨一鹏。
完成了扒老朱家祖坟的壮举之后，起义军开始分兵，老回回等五营攻入湖广，高迎祥、李自成等入汉中，张献忠率部赴信阳。
此时的起义军已经和大明朝廷变成了不死不休的局面，但凡有哪个朝臣官员敢说一句，暂时放下流寇，王贼才是心腹大患，那必然会扣上一个不忠不孝的罪名。
陈奇瑜被下狱之后，洪承畴接替了他五省总督的职位，开始调集兵马赴河南湖广围剿起义军，这时候的曹变蛟也悄悄的带着人马南下汉中了。
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